Identificación y caracterización de los sistemas PKS y NRPS en cepas de actinobacterias halófilas y halotolerantes con actividad antimicrobiana.”

Abstract

La obtención de moléculas bioactivas resulta importante en áreas diversas de las ciencias biológicas, químicas y médicas, debido los usos y aplicaciones que pueden llegar a tener. Estas moléculas son sintetizadas mediante diversas rutas metabólicas por parte de microrganismos como las actinobacterias, estas han ganado atención por la gran cantidad de compuestos naturales que se obtienen de estas, destacando moléculas que son implementadas para el desarrollo de nuevos antibióticos y el mejoramiento de los ya existentes. El potencial biosintético de las actinobacterias y de otros microrganismos se debe principalmente a la presencia de sistemas biosintéticos enzimáticos multimodulares conocidos como sistema policétido sintasa (PKS) y sistema de péptido no ribosómico sintetasa (NRPS). Con el objetivo de detectar la presencia y distribución de estos sistemas enzimáticos antes mencionados, se utilizaron cebadores específicos para detectar los genes que codifican a las enzimas de los sistemas PKS y NRPS en cepas de bacterias halófilas y halotolerantes, que ayudaran en la predicción para la síntesis de moléculas nuevas. Para ello se aislaron en medios MH y BHI suplementados con NaCl al 5%. Se obtuvieron cepas de bacterias, bacterias halófilas y halotolerantes aisladas de muestras ambientales recolectadas de la región salina “Laguna Salada, en la región norte del estado de Baja California. Las bacterias fueron caracterizadas morfológica y fisiológicamente, determinando su rango de crecimiento y crecimiento optimo en diferentes porcentajes de NaCl, pH y temperatura. Se determinó la presencia de los sistemas biosintéticos PKS-I y NRPS-I, implementando cebadores degenerados mediante ensayos de PCR. Las cepas con que presentaron sistemas biosintéticos se identificaron a nivel especie, mediante la secuenciación del gen ARNr 16S, las secuencias consenso obtenidas por los programas CromasPro 1.5 y BioEdit 7.1.9 se compararon con las depositadas en las bases de datos mediante el programa informático BLAST y EZbioclud. Resultados: Se aislaron un total de 114 cepas totales, 16 perteneciente al grupo de las actinobacterias y 98 al grupo de las eubacterias, caracterizadas por su morfología macroscópica y microscópica, se caracterizaron fisiológicamente de acuerdo con su crecimiento optimo en diferentes concentraciones de NaCl, pH y temperatura. Se realizo la detección de los sistemas biosintéticos PKS-I y NRPS-I en 9 cepas de actinobacterias y 20 eubacterias. Las cepas aisladas no mostraron actividad antagonica contra las cepas multirresistentes. La ecología microbiana se vio reflejada en la identificación de 6 géneros de bacterias Bacillus, Citricoccus, Nocardiopsis, Oceanobacillus, Salinicoccus y Salirhabdus.