Resumen:
Con el objetivo de identificar la variación fenotípica del chile manzano (Capsicum pubescens Ruiz y Pavón), se realizó un estudio de caracterización morfológica con 15 colecciones cultivadas en la región sur del estado de México. Se evaluaron 86 caracteres morfológicos (68) tomados de la guía de IPGR 1995 y (18) la guía del SNICS 2014. De todos ellos 59 fueron cualitativos y 27 cuantitativos. Se encontró amplia variabilidad cualitativa con polimorfismos en 29 caracteres cualitativos de los 59 evaluados, así como 98 estados diferentes de los 209 (morfoalelos) descritos en las guías. Las colecciones en promedio tienen 4 morfoalelos por atributo. Los polimorfismos cuantitativos estuvieron relacionados principalmente con atributos de la fruto y los cualitativos estuvieron relacionados con caracteres de flor y fruto. El análisis discriminante separó a las colecciones en cuatro grupos, dos de ellos incluyeron sólo la colección, la colecta 12 identificada por el número de flores axilares y color blanco de la corola y la colecta 11 contraste en forma de fruto alargado. Un tercer grupo incluyó las colectas 1, 2, 8, 9 y 13 que comparten el color rojo de fruto. El cuarto grupo incluyó básicamente las colecciones más comerciales. Para el análisis de componentes principales los cuatro primeros componentes principales explicaron 65% de la variabilidad acumulada principalmente explicado por las características de la planta, flor y fruto. La variabilidad cualitativa y cuantitativa que se encuentra en las colecciones de Capsicum pubescens evaluados indican que hay suficiente variabilidad para los programas de mejoramiento genético de esta especie.
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