Identificación in silico de epítopes inmunogénicos en fragmentos de la Proteína de Membrana Polimórfica (POMP90) en un aislado de Chlamydia abortus de origen mexicano

Abstract

El Aborto Enzoótico Ovino es una enfermedad infecto contagiosa provocada por la bacteria Gram negativa e intracelular obligada Chlamydia abortus; la cual, es una enfermedad de distribución mundial de potencial zoonótico ampliamente documentado. El diagnóstico de este agente suele ser complejo por su naturaleza intracelular, para ello se deben emplear pruebas como aislamiento y prueba de reacción en cadena de la polimerasa específica. Adicionalmente, para el diagnóstico en campo, se deben emplear pruebas serológicas lo que ahorra tiempos de toma y transporte de muestra al laboratorio. Sin embargo, algunas de estas pruebas que se comercializan en países de Europa tienen porcentajes de sensibilidad y especificidad bajos debido a las reacciones cruzadas que muestran los antígenos empleados frente a otros patógenos o especies del mismo género. Para lograr un diagnóstico más certero con este tipo de pruebas de serológicas, es necesario desarrollar prototipos con antígenos más específicos como las Pmp’s, las cuales tienden a variar dependiendo la especie de la cual se sospecha, determinando in silico la presencia de epítopos específicos empleando nuevas tecnologías. El presente trabajo determinó de forma in silico la presencia de epítopos con potencial inmunogénico específicos contra Chlamydia abortus de dos fragmentos de la proteína PMP17G. Se realizó la clonación y secuenciación de los fragmentos y a partir del análisis de estos con el empleo de dos softwares bioinformáticos se detectó la presencia de epítopos contra C. abortus Pomp90-3 (ocho epítopos) y Pomp90-4 (un epítopo). El análisis in silico nos permitió predecir e identificar de manera eficiente epítopos específicos contra C. abortus en ambos fragmentos de la proteína, los cuales serán de utilidad para el desarrollo de técnicas de diagnóstico y desarrollo de inmunógenos