En el valle de Toluca, México, durante el verano de 2003, clones obtenidos por ingeniería genética y por hibridación somática entre Solanum tuberosum y S. bulbocastanum fueron expuestos a infección natural por Phytophthora infestans, a fin de cuantificar su resistencia al oomiceto, previamente comprobada en otras condiciones. El objetivo fue identificar los genotipos de P. infestans que selectiva y progresivamente infectaron a los clones de papa. La mayoría de éstos fueron resistentes en los estados tempranos de crecimiento, aunque se presentó infección gradual posteriormente. Se identificaron 21 variantes de P. infestans con base al tipo de compatibilidad (TC) y a los perfiles multilocus aloenzimáticos de glucosa-6-fosfato isomerasa (Gpi) y peptidasa (Pep ). A la sexta semana postsiembra se obtuvieron las primeras infecciones por cinco aislamientos en el testigo no transformado (H6, cv. Katahdin). A la siguiente semana, en el mismo hospedante, se aislaron otros cinco genotipos de P. infestans, cuatro de ellos diferentes a los de la semana anterior, y se presentaron otros cuatro genotipos en un clon que no adquirió la transgenia (H4). Ambos clones murieron a la mitad del ciclo de cultivo. Los genotipos más frecuentes infectando todos los clones, principalmente al final del ciclo, fueron A1, 100/100, 100/100 (TC, Gpi, Pep , 19%), y A2, 100/100, 100/100 (14%). La proporción A1:A2 para toda la población fue 1:1 (86,77; 52,7%:47,3%). Se concluye que hubo gran diversidad genética de P. infestans, que los transgenes que confieren la resistencia funcionaron bien en plantas jóvenes, al principio del ciclo de cultivo, y no se observó especificidad hospedero-patógeno.